少年三国志作为一款策略卡牌手游，其核心玩法围绕武将收集、阵容搭配和资源管理展开。游戏提供了主线副本、名将副本和日常副本三种基础模式，分别对应剧情推进、武将碎片获取和日常资源积累。主线副本是玩家升级和获取基础材料的主要途径，通关后解锁精英副本和名将副本，后者首次通关可获得额外元宝奖励。日常副本则按固定周期开放，提供不同难度的挑战选项，每日可免费攻打一次并消耗元宝购买额外次数。
夺宝系统和竞技场构成了游戏的PVP核心内容。夺宝模式通过夺取其他玩家宝物碎片来合成完整宝物，需根据对手实力调整战术。竞技场采用实时排名机制，玩家通过击败排名更高的对手提升名次，每日结算时根据排名发放声望、银两和培养丹奖励。这两种模式均强调阵容搭配的灵活性和对战局的预判能力，高伤队伍、控制输出队伍和辅助消耗队伍是当前主流的三种战术流派。
军团系统和社交玩法为游戏增加了长期目标。玩家达到38级可创建或加入军团，通过封禅祭天提升军团等级解锁更多福利。军团副本、围剿叛军等协作玩法要求成员合理分配资源，而铜雀台定时领取体力、迎财神获取银两等设计则强化了日常参与感。社交方面支持好友组队、组织建设及宴请互动，这些机制有效延长了玩家的游戏生命周期。
特殊玩法如战宠系统、宝物精炼和战马系统提供了深度养成维度。战宠可提供属性加成并释放战斗技能，宝物通过强化和精炼提升附加属性，战马则赋予武将额外技能。这些系统与主线进度挂钩，需平衡资源投入与战力提升的关系。三国志系统的命星点亮机制和拍卖行的稀有道具交易，进一步丰富了游戏的策略选择空间。
游戏通过富甲天下系列活动整合了多种限时玩法，包括皇陵探宝、奇门八卦等随机事件。这些活动不消耗常规资源，但要求玩家具备快速调整阵容的能力。过关斩将作为高阶挑战副本，三星通关后不可重复挑战，其奖励机制鼓励玩家持续优化阵容配置。少年三国志通过多种模式的有机组合，构建了兼顾短期目标与长期养成的玩法生态。
